二氧化氯消毒剂是国际上公认的消毒灭菌剂，它可以杀灭大肠杆菌等。二氧化氯对微生物细胞壁有较强的吸附穿透能力，可有效地氧化细胞内含巯基的酶，还可以快速地抵制微生物蛋白质的合成来破坏微生物。

1992年，中国食品添加剂委员会批准，二氧化氯可用于鱼类加工过程，控制杂菌、大肠菌等污染。1996年，我国将二氧化氯列入食品添加剂中的“防腐剂”。2002年卫生部《消毒技术规范》的通知[卫法监发第282号文]规定二氧化氯可广泛用于食品加工、空间环境、管道、容器的杀菌、饮用水和工业循环水、工业废水的杀菌、服装织物用品的漂白消毒。